最早受到关注的吸烟带来的健康问题有两个方向，一个是吸烟人口的肺癌和肺阻塞的发病率高于非吸烟者，另外一个方向是母亲在怀孕阶段吸烟导致婴儿体重普遍偏低。这两个方向显现出的问题，引起了学术界与政府的高度关注。从研究进程来看，吸烟对生殖健康带来的影响，经历了不同的时期，不断有临床资料支撑吸烟对人类生殖健康带来的危害的证据。
女性吸烟导致婴儿体重降低，引起了各方的关注。1964年美国卫生总署的报告中，提到了母亲吸烟与新生儿体重过低之间存在关系。1969年美国卫生总署的报告中，确定了母亲吸烟与新生儿体重过低之间的联系，并且确定了吸烟与早产、自发性流产、死胎和新生儿死亡的发生率之间的关系。1977年到1978年的报告提到了胎盘前置、胎盘早剥、怀孕期间出血、延长胎膜早破等与母亲吸烟的剂量有关，同时还提到了母亲吸烟影响到孩子的智力与体力的发育。1997年的报告认为了母亲吸烟导致婴儿猝死，1980年报告指出，美国高达14%的早产可能归因于母亲吸烟。
在新生儿体重与母亲吸烟之间存在明显的剂量依赖关系。与非吸烟者相比，轻度吸烟与重度吸烟者，分别有54％与130％的几率新生儿体重低于2500克。几项研究表明，在怀孕前或怀孕期间戒烟可以部分逆转孩子出生体重的减少。在一项使用1970年英国出生队列的大型研究中，社会阶层的衡量标准与吸烟率之间的反比关系表明，这与美国相似。在所有社会阶层群体中，不吸烟者的婴儿比母亲在怀孕期间吸烟的婴儿体重更重。在怀孕前或怀孕期间戒烟的妇女的婴儿出生体重高于在整个怀孕期间继续吸烟的妇女。
关于母亲吸烟对胎儿和新生儿的影响的最广泛接受的假设是宫内缺氧。缺氧可能是由于与吸烟相关的因素而发生的。例如血液中一氧化碳（CO）水平升高。减少血流量或抑制呼吸酶。有强有力的实验证据表明，母亲吸烟会导致胎儿低血压。
吸烟妇女在怀孕与生产过程中导致婴儿死亡率攀升。有研究资料显示，在1344292例初产妇中，婴儿死亡率，对非吸烟母亲为15.1/1000，吸烟少于一包的为18.1/1000，吸烟多于一包的为23.2/1000。吸烟妇女胎儿新生儿期和新生儿后期死亡率增加。据估计，如果所有孕妇都戒烟。胎儿和婴儿死亡人数减少约10%。
吸烟与先天性畸形关系不是很清晰。在不同的研究中，发现母亲吸烟导致先天性畸形的几率较不吸烟的要大些。也有研究表明，父亲在怀孕期间吸烟导致先天性畸形的可能性较大。女性吸烟会实质性的降低其生育能力。吸烟的女性不采取避孕措施一年以上才能怀孕的是非吸烟女性的3.8倍。吸烟影响到男性精子的活力、密度计形态异常。与非吸烟者相比，吸烟者精子的活力、密度较低，形态异常的比非吸烟者多。
研究发现，儿童精神发育迟缓发生的几率吸烟母亲为15.9／1000，非吸烟母亲为13.9／1000，将脑瘫、癫痫和精神发育迟缓几率放在一起，吸烟母亲为42.8/1000，而非吸烟母亲为34／1000。儿童中多动症、注意力不集中、拼写和阅读低分他们的母亲更多是吸烟者。